Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC3Q9UQE7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms