Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF18Q9UNG2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms