Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2LQ9UL33 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2LQ9UL33 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms