Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS29Q9UBQ0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS29Q9UBQ0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS29Q9UBQ0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS29Q9UBQ0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS29Q9UBQ0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS29Q9UBQ0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS29Q9UBQ0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS29Q9UBQ0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms