Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CACNA2D2Q9NY47 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNA2D2Q9NY47 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms