Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO28Q9NVF7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms