Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOMER3Q9NSC5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms