Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BATF3Q9NR55 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BATF3Q9NR55 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BATF3Q9NR55 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BATF3Q9NR55 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BATF3Q9NR55 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BATF3Q9NR55 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BATF3Q9NR55 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BATF3Q9NR55 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BATF3Q9NR55 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BATF3Q9NR55 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BATF3Q9NR55 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BATF3Q9NR55 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BATF3Q9NR55 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BATF3Q9NR55 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BATF3Q9NR55 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BATF3Q9NR55 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BATF3Q9NR55 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BATF3Q9NR55 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BATF3Q9NR55 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms