Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ASCL3Q9NQ33 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ASCL3Q9NQ33 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms