Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FZD3Q9NPG1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms