Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSG1Q9H089 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSG1Q9H089 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSG1Q9H089 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms