Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D2

CEP295, Centrosomal protein of 295 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295Q9C0D2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CEP295Q9C0D2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CEP295Q9C0D2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CEP295Q9C0D2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CEP295Q9C0D2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CEP295Q9C0D2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP295Q9C0D2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP295Q9C0D2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP295Q9C0D2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP295Q9C0D2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP295Q9C0D2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CEP295Q9C0D2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms