Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM6Q9C030 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM6Q9C030 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms