Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM7Q9C029 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM7Q9C029 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms