Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNHG12Q9BXW3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNHG12Q9BXW3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms