Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VAMP8Q9BV40 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VAMP8Q9BV40 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms