Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RHOXF2Q9BQY4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2Q9BQY4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms