Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNS3Q9BQ31 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms