Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP9Q99956 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms