Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID3AQ99856 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID3AQ99856 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID3AQ99856 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID3AQ99856 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms