Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY1Q96T51 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUFY1Q96T51 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms