Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CRBNQ96SW2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms