Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GCNAQ96QF7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms