Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC136Q96JN2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC136Q96JN2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC136Q96JN2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms