Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
LRRIQ1Q96JM4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
LRRIQ1Q96JM4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms