Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF479Q96JC4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF479Q96JC4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms