Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SHISA4Q96DD7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHISA4Q96DD7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms