Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCTD12Q96CX2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD12Q96CX2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms