Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
OPTNQ96CV9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms