Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLUAP1Q96AJ1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLUAP1Q96AJ1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms