Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF3C6Q969F1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C6Q969F1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
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