Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC148Q8NFR7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC148Q8NFR7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms