Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ0

DUSP18, Dual specificity protein phosphatase 18, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18Q8NEJ0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DUSP18Q8NEJ0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP18Q8NEJ0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms