Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLGALT1Q8NBJ5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms