Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM20Q8N5G0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM20Q8N5G0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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