Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2M8

CLASRP, CLK4-associating serine/arginine rich protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASRPQ8N2M8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLASRPQ8N2M8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLASRPQ8N2M8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms