Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOT1Q8IXI2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms