Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGDCC3Q8IVU1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGDCC3Q8IVU1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms