Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRAPQ7Z569 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAPQ7Z569 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms