Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMUB2Q71RG4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMUB2Q71RG4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms