Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HACD2Q6Y1H2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HACD2Q6Y1H2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms