Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TSSK4Q6SA08 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSK4Q6SA08 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms