Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPPQ6IPU0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms