Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZB9

DMRTA1, Doublesex- and mab-3-related transcription factor A1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRTA1Q5VZB9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DMRTA1Q5VZB9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms