Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf135Q5VTT2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf135Q5VTT2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms