Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFI1BQ5VTD9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms