Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOGA3Q5TF21 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms