Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA50

CPTP, Ceramide-1-phosphate transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPTPQ5TA50 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CPTPQ5TA50 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CPTPQ5TA50 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms