Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBAP2Q5T6F2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBAP2Q5T6F2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms