Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATAD3CQ5T2N8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms